スカイマークは19日、10月25日から始まる2020年冬ダイヤを発表した。
2020年10月25日～2021年3月27日期間の運航について（SKYプレスリリース）
神戸発着路線は下地島（宮古島）線が新たに新規開設される一方で、新千歳・羽田線の深夜便等が減便となり、運航便数は夏ダイヤに比べ計4往復減の8路線23往復の運航が予定されている。各路線の運航路線・ダイヤは下記の通り。
| 新千歳線（1日3往復） | |||||
| 便名 | 神戸発 | 現地着 | 便名 | 現地発 | 神戸着 |
| 171 | 8:10 | 9:55 | 172 | 11:45 | 13:50 |
| 173 | 12:35 | 14:25 | 174 | 15:40 | 17:45 |
| 175 | 15:55 | 17:45 | 178 | 18:25 | 20:30 |
| 仙台線（1日2往復） | |||||
| 便名 | 神戸発 | 現地着 | 便名 | 現地発 | 神戸着 |
| 152 | 8:30 | 9:50 | 153 | 10:25 | 11:55 |
| 156 | 17:35 | 18:55 | 157 | 19:35 | 21:05 |
| 茨城線（1日2往復） | |||||
| 便名 | 神戸発 | 現地着 | 便名 | 現地発 | 神戸着 |
| 182 | 7:55 | 9:05 | 183 | 8:35 | 9:55 |
| 186 | 19:05 | 20:10 | 187 | 19:45 | 21:05 |
| 羽田線（1日7往復） | |||||
| 便名 | 神戸発 | 現地着 | 便名 | 現地発 | 神戸着 |
| 102 | 7:10 | 8:30 | 101 | 7:20 | 8:40 |
| 104 | 9:20 | 10:25 | 103 | 9:10 | 10:30 |
| 106 | 11:10 | 12:20 | 105 | 13:05 | 14:25 |
| 108 | 13:10 | 14:20 | 107 | 14:00 | 15:15 |
| 110 | 14:40 | 15:50 | 109 | 15:35 | 16:55 |
| 112 | 16:30 | 17:40 | 113 | 17:40 | 19:00 |
| 116 | 19:05 | 20:15 | 117 | 20:05 | 21:25 |
| 長崎線（1日3往復） | |||||
| 便名 | 神戸発 | 現地着 | 便名 | 現地発 | 神戸着 |
| 141 | 9:15 | 10:25 | 140 | 7:40 | 8:45 |
| 145 | 15:05 | 16:25 | 142 | 11:00 | 12:05 |
| 147 | 19:40 | 20:55 | 148 | 17:20 | 18:25 |
| 鹿児島線（1日2往復） | |||||
| 便名 | 神戸発 | 現地着 | 便名 | 現地発 | 神戸着 |
| 131 | 7:40 | 8:50 | 132 | 9:15 | 10:20 |
| 137 | 18:25 | 19:35 | 138 | 20:25 | 21:30 |
| 那覇線（1日3往復） | |||||
| 便名 | 神戸発 | 現地着 | 便名 | 現地発 | 神戸着 |
| 591 | 7:30 | 9:45 | 594 | 14:05 | 15:55 |
| 593 | 11:00 | 13:15 | 596 | 16:40 | 18:30 |
| 597 | 17:00 | 19:15 | 598 | 20:10 | 22:05 |
| 下地島線（1日1往復） | |||||
| 便名 | 神戸発 | 現地着 | 便名 | 現地発 | 神戸着 |
| 163 | 10:40 | 13:20 | 164 | 14:10 | 16:15 |
※最新の運航情報・運賃等はSKY公式サイトを参照されたい。
